Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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FOXO1Q12778 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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FOXO1Q12778 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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