Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms