Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms