Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms