Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TGM3Q08188 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TGM3Q08188 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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