Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.9 ms