Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms