Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms