Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP27A1Q02318 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms