Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms