Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PITPNAQ00169 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms