Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms