Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UFM1P61960 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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