Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACTBP60709 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACTBP60709 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACTBP60709 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ACTBP60709 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ACTBP60709 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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ACTBP60709 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ACTBP60709 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ACTBP60709 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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