Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DAP3P51398 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DAP3P51398 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DAP3P51398 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DAP3P51398 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DAP3P51398 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DAP3P51398 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DAP3P51398 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DAP3P51398 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DAP3P51398 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DAP3P51398 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DAP3P51398 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DAP3P51398 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DAP3P51398 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms