Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms