Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms