Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJC1P36383 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJC1P36383 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms