Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms