Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms