Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms