Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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