Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GCSHP23434 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GCSHP23434 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms