Protein–RNA interactions for Protein: P19419

ELK1, ETS domain-containing protein Elk-1, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1P19419 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELK1P19419 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELK1P19419 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELK1P19419 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELK1P19419 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELK1P19419 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELK1P19419 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELK1P19419 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELK1P19419 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELK1P19419 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELK1P19419 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELK1P19419 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ELK1P19419 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms