Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LBPP18428 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LBPP18428 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LBPP18428 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LBPP18428 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LBPP18428 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LBPP18428 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LBPP18428 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LBPP18428 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LBPP18428 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LBPP18428 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LBPP18428 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LBPP18428 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LBPP18428 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LBPP18428 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LBPP18428 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LBPP18428 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LBPP18428 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LBPP18428 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LBPP18428 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LBPP18428 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LBPP18428 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms