Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms