Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TPRP12270 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TPRP12270 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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