Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DMDP11532 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DMDP11532 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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