Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms