Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms