Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTXN2P0C2S0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms