Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4BP0C0L5 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms