Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SFTPBP07988 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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SFTPBP07988 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SFTPBP07988 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SFTPBP07988 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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