Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F9P00740 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F9P00740 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F9P00740 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F9P00740 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F9P00740 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F9P00740 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F9P00740 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F9P00740 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F9P00740 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F9P00740 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F9P00740 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F9P00740 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F9P00740 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F9P00740 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F9P00740 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F9P00740 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms