Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN7O94888 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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