Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIOO75962 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIOO75962 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIOO75962 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIOO75962 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIOO75962 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIOO75962 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIOO75962 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIOO75962 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms