Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TULP3O75386 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TULP3O75386 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TULP3O75386 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TULP3O75386 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TULP3O75386 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TULP3O75386 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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