Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ACSL4O60488 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ACSL4O60488 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ACSL4O60488 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ACSL4O60488 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ACSL4O60488 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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