Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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PDE6DO43924 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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PDE6DO43924 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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PDE6DO43924 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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PDE6DO43924 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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PDE6DO43924 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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PDE6DO43924 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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PDE6DO43924 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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PDE6DO43924 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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PDE6DO43924 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDE6DO43924 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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