Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC28A2O43868 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC28A2O43868 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC28A2O43868 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms