Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms