Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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