Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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KCNIP3Q9Y2W7 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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KCNIP3Q9Y2W7 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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KCNIP3Q9Y2W7 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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KCNIP3Q9Y2W7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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KCNIP3Q9Y2W7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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KCNIP3Q9Y2W7 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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KCNIP3Q9Y2W7 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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KCNIP3Q9Y2W7 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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KCNIP3Q9Y2W7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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KCNIP3Q9Y2W7 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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KCNIP3Q9Y2W7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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