Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK2Q9UPX8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms