Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms