Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD1Q9UP38 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms