Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK13

ZNF221, Zinc finger protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF221Q9UK13 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF221Q9UK13 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms