Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2IRD1Q9UHL9 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms