Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFIP11Q9UBB9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms