Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms